Экологический терроризм Армении оказал негативное воздействие и на систему управления водными ресурсами в Азербайджане. Армянская оккупация территорий Азербайджана лишала сотни тысяч граждан Азербайджана питьевой воды, являясь причиной эрозии почв, обезвоживания и опустынивания земель и серъезно сказывается на природных ресурсах, флоре и фауне региона.